Suyu bakteriyalardan təmizləmək üçün bir neçə effektiv metod mövcuddur. Ən sadə və geniş istifadə edilən üsul suyu qaynatmaqdır.

Suyu ən azı 1-3 dəqiqə qaynatmaq bakteriyaların öldürülməsini təmin edir. Bundan başqa, su filtrləri də bakteriyaları təmizləməkdə çox faydalıdır. Aktiv karbon və keramika filtrləri suyu mikroorqanizmlərdən təmizləmək üçün istifadə edilə bilər. UV işığı da bakteriyaları öldürmək üçün effektiv bir üsuldur və UV su təmizləyiciləri ilə suyu sterilizə etmək mümkündür. Kimyəvi maddələrdən, məsələn, klor və iodin tabletələrindən istifadə edərək suyu dezinfeksiya etmək də mümkündür. Ayrıca, distillə etmə metodu da suyu bakteriyalardan təmizləmək üçün istifadə edilə bilər; burada su buxarlanır və mikroorqanizmlərdən ayrılır. Suyun təmizlənməsi zamanı zəhərli maddələrin və ağır metalların da təmizlənməsi vacibdir. Aktiv karbon filtrləri və tərs osmoz (reverse osmosis) sistemləri bu məqsədlə istifadə edilə bilər. Seçilən metodun effektivliyi suyun çirklənmə səviyyəsindən asılıdır.

Bir qrup çinli alim su nümunələrində bakteriyaları aşkarlaya və məhv etməyə qadir olan innovativ üç komponentli biosensor yaradıblar. Cihaz üç əsas hissədən ibarətdir: yanacaq hüceyrəsi, aptamerlər və gümüş nanohissəciklər. Yanacaq hüceyrəsi fermentlərə əsaslanır və su ilə təmasda olduqda kimyəvi reaksiyalar vasitəsilə elektrik enerjisi yaradır. Aptamerlər “E.coli” bakteriyalarına bağlana bilən xüsusi antikorlardır. Bu DNT molekullarında patogenlərin dəqiq aşkarlanmasını təmin edir. Gümüş nanohissəciklər isə oksidləşdikdə mikrobları məhv edən hidrogen peroksid əmələ gətirir. Təcrübə zamanı biosensor yüksək effektivlik nümayiş etdirib.